Résumé
Il n'est plus nécessaire de souligner l'importance du rôle que joue, chez l'être humain, le microbiote intestinal, tant sur le plan quantitatif, que sur le plan qualitatif. Un corps humain contient, en effet, dix fois plus de cellules bactériennes que de cellules humaines. Ces bactéries sont principalement localisées dans le colon, mais aucune partie du corps, interne (muqueuses) ou externe néchappe à la colonisation microbienne. En outre, plus de la moitié des métabolites présents dans les fluides corporels (sang, urines, ) sont d'origine bactérienne, et non pas humaine. Ce microbiote semble également jouer un rôle déterminant dans de nombreux états pathologiques : obésité, états inflammatoires conduisant au diabète de type II, aux problèmes cardio-vasculaires, cancer,
Les travaux le plus récents, basés sur des approches de métagénomique (extraction de l'ADN bactérien et séquençage de grands fragments après clonage dans des vecteurs de type cosmide ou fosmide) permettent de caractériser de manière de plus en plus précise la composition de ce microbiote.