La recherche post-mortem est indispensable pour améliorer la connaissance en médecine légale thanatologique dans la recherche des causes de la mort. Cette recherche comprend les analyses conduites au cours des autopsies judiciaires et les recherches sur les collections d'échantillons biologiques (prélèvements supplémentaires réalisés en cours d'autopsie ou scellés judiciaires). Actuellement de nombreuses publications scientifiques portent sur des études rétrospectives. Il s’avère indispensable d’organiser des études prospectives, comparatives et multicentriques pour permettre des échanges entre les chercheurs au niveau international. En France, alors que les textes relatifs à la recherche visent les sujets vivants, la recherche conduite lors des autopsies judiciaires n'est pas spécifiquement définie puisque le cadavre est temporairement placé sous l’autorité de la justice. Toutefois des prélèvements sur le corps humain après la mort sont autorisés par la loi à visée scientifique et les textes permettent de dessiner un cadre pour la recherche en médecine légale. Notre présentation s’attachera à identifier les obstacles et questions posées par la conduite des recherches en médecine légale qui doivent prendre en compte les volontés et des droits des personnes et de leur famille tout en respectant des besoins de la justice. Mots-clés : Recherche post-mortem, Médecine légale thanatologique, Autopsie, Protection légale du cadavre, Scellés judiciaires.