Résumé

L’homme vit en relations étroites avec cent mille milliards de bactéries qui colonisent naturellement sa peau et ses cavités naturelles ouvertes sur l’extérieur, cavités buccales et vaginales, voies aéro-digestives supérieures, tractus gastro-intestinal. Chacun de ces sites est colonisé par une flore microbienne ou microbiote dont la composition lui est propre. La flore intestinale est la plus importante sur le plan quantitatif et on estime que le tube digestif abrite près de 1014 micro-organismes, c’est-à-dire dix fois plus que le nombre de cellules qui composent le corps humain. Le tube digestif et la flore qu’il abrite forment un écosystème, concept introduit pour la première fois par Dubos et Schaedler (Dubos & Schaedler, 1964). Les populations microbiennes du tube digestif entretiennent en effet des interactions multiples entre elles et avec l’hôte dans une relation de mutualisme (Bäckhed et al., 2005).